β-烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸（NADP?）在细胞呼吸中主要通过转化为还原型辅酶 Ⅱ（NADPH）发挥作用，具体如下：
一、参与磷酸戊糖途径
磷酸戊糖途径是细胞呼吸的一条重要支路，β-烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸在该途径中作为氢受体。葡萄糖-6-磷酸在葡萄糖-6-磷酸脱氢酶的作用下脱氢，将氢传递给 NADP?，使其还原为 NADPH，同时生成6-磷酸葡萄糖酸内酯，这一过程是磷酸戊糖途径的关键步骤，不仅产生了NADPH，还生成了核糖-5-磷酸等重要中间产物。
NADPH在磷酸戊糖途径中可用于维持细胞内谷胱甘肽的还原状态。谷胱甘肽是一种重要的抗氧化剂，还原型谷胱甘肽可以保护细胞免受氧化损伤。当细胞内出现过多的活性氧物质时，NADPH将氧化型谷胱甘肽还原为还原型谷胱甘肽，自身被氧化为β-烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸，从而保证细胞的氧化还原平衡。
二、为脂肪酸等物质合成提供还原力
细胞呼吸产生的乙酰-辅酶A是合成脂肪酸等物质的重要原料，而脂肪酸合成过程需要大量的还原力。NADPH作为供氢体，为脂肪酸合成中的关键酶提供所需的氢原子，参与脂肪酸链的延长和还原反应，使乙酰-辅酶A逐步合成脂肪酸。因此，NADPH将细胞呼吸过程与脂肪酸等物质的合成代谢联系起来，为细胞的物质合成提供了必要条件。
三、参与柠檬酸-丙酮酸循环
在细胞呼吸的过程中，细胞质中的 NADPH 可以通过柠檬酸 - 丙酮酸循环来实现其穿梭作用。具体来说，在细胞质中，乙酰 - 辅酶 A 与草酰乙酸结合生成柠檬酸，柠檬酸可以通过线粒体膜上的载体进入线粒体。在线粒体内，柠檬酸在柠檬酸裂解酶的作用下重新生成乙酰-辅酶A和草酰乙酸，同时消耗ATP。草酰乙酸则在苹果酸脱氢酶的作用下被还原为苹果酸，苹果酸又在苹果酸酶的作用下脱羧生成丙酮酸，同时将β-烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸还原为 NADPH。丙酮酸可以通过线粒体膜上的载体回到细胞质中，继续参与细胞呼吸或其他代谢过程。通过柠檬酸-丙酮酸循环，NADPH可以将线粒体中产生的还原力转移到细胞质中，用于脂肪酸合成等细胞质中的代谢反应。
虽然NADPH在细胞呼吸中的作用不如NADH（β - 烟酰胺腺嘌呤二核苷酸）直接参与电子传递链产生ATP那样显著，但它在维持细胞的氧化还原平衡、参与物质合成以及代谢途径之间的联系等方面发挥着不可或缺的作用。
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